Bioinformatika: Jaký je rozdíl mezi zarovnáním jednoho rychlého čtení na STAR a sladěním dvou rychlých čtení na STAR mezi sebou? http://www.genefriends.org/RNAseqForDummies/


Odpověď 1:

Co myslíš jedním fastqem nebo dvěma fastqem? Myslíte si, že čtete na jednom konci nebo na párovaném konci? Vždy se můžete dozvědět rozdíl mezi účinností jednoho konce a účinností spárovaných koncových sekvencí. Je to kvůli zachycení a pokrytí a scvrkává se na mnohem vyšší přesnou znalost transkriptů s menším počtem artefaktů a falešných pozitiv.